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Éminente entomologiste, Katherine Krall participe à des recherches pour la fondation monégasque Green Rock Planet. Entourée d'une équipe de chercheurs, elle a été nommée pour diriger une mission en Amazonie. Un matin, Yaméo, une vieux chaman, fait irruption dans leur campement. Il vient demander de l'aide pour sa tribu, celle des Waimiri. À la lumière de son témoignage troublant, la chercheuse accepte de la suivre aux confins de la jungle...
À mi-chemin du roman d'aventure et du thriller, Dans l'ombre du jaguar est avant tout une réflexion sur les enjeux écologiques actuels qui touchent notre planète sur fond de capitalisme hégémonique effréné, sans état d'âme.