Stockholm, 1650. Dans une chambre, un homme écrit. Il sait qu'il va bientôt mourir et qu'il lui reste peu de temps pour dire la vérité. Cet homme, c'est René Descartes, l'un des plus grands philosophes de l'époque. En exil chez la reine Christine de Suède, il subit l'hostilité des courtisans et la vindicte des jésuites. Malgré la fatigue, il rédige l'histoire de sa vie. Il revient sur son éducation, ses travaux, ses livres, son engagement dans l'armée, ses errances, ses rencontres, ses amours et la perte de sa fille Francine.
Ce "testament" est aussi traversé par les figures remarquables de cette première moitié du XVIIe siècle comme Pascal, Galilée ou Saint Vincent de Paul. Descartes y apparaît comme le personnage du roman de la raison, un penseur libre dans une période de violence religieuse, un écrivain poursuivi pour ses idées, un philosophe qui se demande ce que peut la philosophie face à la disparition d'un enfant.