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Congo belge, seconde moitié du XIXe siècle. Dans sa quête de la cible, Lilith va devoir affronter les périls de la jungle équatoriale dans l'immense bassin fluvial du Congo, où commence l'exploitation brutale des terres et l'asservissement des indigènes. C'est aussi l'époque des grands explorateurs occidentaux qui ont cartographié pour la première fois l'Afrique équatoriale. La route de Lilith croisera celle du célèbre Henry Morton Stanley, engagé dans la malheureuse expédition de sauvetage d'Emin Pacha.
Pour soutenir Lilith dans sa recherche, il y a un jeune capitaine polonais, Konrad Korzeniowski, qui sera plus tard connu sous le nom de Joseph Conrad. Ensemble, ils pénétreront dans le "coeur des ténèbres" du grand fleuve, remontant "jusqu'aux origines les plus lointaines du monde, lorsque la végétation parcourait la terre et que les grands arbres étaient rois".